More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5677 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  55.15 
 
 
219 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  53.88 
 
 
207 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  56.77 
 
 
229 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  56.38 
 
 
209 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  51.53 
 
 
206 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  52.06 
 
 
211 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  55 
 
 
200 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  53.65 
 
 
208 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  51.66 
 
 
210 aa  214  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  54.17 
 
 
215 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  55.21 
 
 
212 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  50.26 
 
 
199 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  54.69 
 
 
212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  50.49 
 
 
215 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  53.65 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  52.6 
 
 
214 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  53.06 
 
 
203 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  52.08 
 
 
227 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  49.73 
 
 
210 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  54.08 
 
 
387 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  54.84 
 
 
217 aa  208  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  51.76 
 
 
217 aa  208  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  54.82 
 
 
380 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  51.02 
 
 
203 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  52.02 
 
 
201 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  50.51 
 
 
201 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  51.02 
 
 
204 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  51.02 
 
 
203 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  51.01 
 
 
201 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  45.73 
 
 
215 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  53.09 
 
 
201 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  47.94 
 
 
211 aa  204  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  50.49 
 
 
205 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  50.49 
 
 
205 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  53.37 
 
 
219 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  51.01 
 
 
201 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  52.38 
 
 
223 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  54.5 
 
 
213 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  50 
 
 
205 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  47.98 
 
 
212 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  50.49 
 
 
205 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  45.93 
 
 
205 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  53.57 
 
 
258 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  50.49 
 
 
205 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  51.85 
 
 
223 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  51.55 
 
 
226 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  50 
 
 
204 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  46.19 
 
 
218 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  51.78 
 
 
223 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  51.55 
 
 
226 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  49.49 
 
 
204 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  52.06 
 
 
226 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  48.7 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  51.04 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  50.26 
 
 
220 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  52.85 
 
 
258 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  51.03 
 
 
221 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  53.12 
 
 
258 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  48.45 
 
 
213 aa  198  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  48.45 
 
 
213 aa  198  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  46.23 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
220 aa  198  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  46.23 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  48.45 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  48.45 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  46 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  54.08 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  48.47 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  47.37 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  48.73 
 
 
220 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  47.64 
 
 
209 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  52.6 
 
 
256 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  51.31 
 
 
221 aa  194  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  51.28 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  46.31 
 
 
218 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  47.89 
 
 
220 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  47.09 
 
 
196 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  47.52 
 
 
255 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  52.6 
 
 
250 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  52.26 
 
 
255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  47.89 
 
 
220 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  52.26 
 
 
255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  52.26 
 
 
255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  47.09 
 
 
220 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  53.06 
 
 
256 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.66431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>