More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1281 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  47.69 
 
 
204 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  43.3 
 
 
194 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  43.52 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  43.52 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  43.46 
 
 
201 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  41.36 
 
 
215 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  41.24 
 
 
211 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  41.36 
 
 
196 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  39.47 
 
 
199 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  33.68 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  41.97 
 
 
195 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  41.97 
 
 
200 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  40.93 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.2 
 
 
242 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.92 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  39.29 
 
 
231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  35.32 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  35.53 
 
 
248 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  34.67 
 
 
211 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 
235 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  34.67 
 
 
211 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  37.31 
 
 
223 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  35.53 
 
 
225 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  38.27 
 
 
219 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  37.76 
 
 
217 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  34.85 
 
 
255 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40.41 
 
 
356 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  34.33 
 
 
213 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  35.75 
 
 
877 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  35.18 
 
 
211 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  34.69 
 
 
242 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  33.16 
 
 
243 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  36.65 
 
 
218 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  36.73 
 
 
219 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  34.18 
 
 
246 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  36.63 
 
 
214 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  36.46 
 
 
251 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  34 
 
 
213 aa  121  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  40.32 
 
 
229 aa  121  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.9 
 
 
258 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  34.03 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  35.03 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  34.18 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  34.9 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  36.55 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  35.98 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  32.65 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  35.08 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  34.18 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  36.65 
 
 
219 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  36.65 
 
 
219 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  36.65 
 
 
219 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  36.65 
 
 
219 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  36.65 
 
 
219 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  36.65 
 
 
219 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  35.86 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  36.13 
 
 
219 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  33.99 
 
 
215 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  32.65 
 
 
239 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  36.79 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  36.13 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  32.98 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  35.2 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  34.52 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  32.99 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  35.9 
 
 
219 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  32.65 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  33.5 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  35.5 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  32.65 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  32.67 
 
 
225 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  34.01 
 
 
219 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  33.99 
 
 
214 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  37.37 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  33.5 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  32.82 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  32.67 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  36.32 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  34.54 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  33.16 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  34.02 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.2 
 
 
200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  31.86 
 
 
218 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  32.67 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  34.52 
 
 
211 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  35.32 
 
 
211 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  33.85 
 
 
239 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  35.32 
 
 
211 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  35.32 
 
 
211 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  34.01 
 
 
216 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>