83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0423 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0417  extensin family protein  100 
 
 
227 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.599448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0423  extensin family protein  100 
 
 
227 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.933348  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0416  extensin family protein  99.12 
 
 
237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.039065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0435  extensin family protein  99.56 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.250587  normal  0.722758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0477  extensin family protein  99.56 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0851  extensin family protein  69.16 
 
 
227 aa  342  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.223472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2133  Extensin family protein  50.22 
 
 
231 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1846  Extensin family protein  49.78 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0656  extensin-like protein  44.44 
 
 
235 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1323  extensin-like, C-terminal  43.4 
 
 
229 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1116  extensin family protein  43.66 
 
 
229 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.822748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1513  hypothetical protein  41.92 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1511  extensin family protein  42.08 
 
 
229 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4211  extensin family protein  42.01 
 
 
229 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1458  hypothetical protein  46.63 
 
 
231 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16750  hypothetical protein  44.95 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4106  extensin family protein  40.36 
 
 
224 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1075  extensin-like protein  42.25 
 
 
230 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39250  hypothetical protein  39.74 
 
 
222 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.926206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3988  Extensin family protein  40.18 
 
 
278 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3354  extensin family protein  40.57 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1529  extensin family protein  34.85 
 
 
264 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1329  extensin family protein  29.44 
 
 
244 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000197088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1661  extensin-like  36.56 
 
 
231 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0618  extensin-like protein  37.22 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2632  Extensin family protein  37.14 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0848  extensin family protein  33.99 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846285  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0871  extensin family protein  32.22 
 
 
238 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0664  extensin-like protein  31.07 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0161658  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3714  Extensin family protein  33.55 
 
 
341 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0977597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1728  extensin family protein  28.21 
 
 
401 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2099  extensin-like  34.75 
 
 
288 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2458  extensin-like protein  33.59 
 
 
372 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480313  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3408  extensin-like  31.3 
 
 
415 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0393857  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2770  extensin-like  34.27 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4063  Extensin family protein  31.3 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3312  extensin family protein  29.87 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209178  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2885  extensin-like  31.3 
 
 
401 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1978  extensin-like protein  30.53 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259223  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2944  hypothetical protein  29.39 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0362453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2121  extensin-like  31.37 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6195  hypothetical protein  31.93 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2178  extensin-like  30.53 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1036  hypothetical protein  30.92 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.507512  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2211  extensin family protein  28.57 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2120  extensin-like  30.36 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0950  extensin family protein  30.2 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00924534  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2935  extensin family protein  34.39 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1300  Extensin family protein  28.86 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0538654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1509  hypothetical protein  26.04 
 
 
303 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1459  hypothetical protein  26.04 
 
 
299 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0853  Extensin family protein  29.53 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0822  hypothetical protein  37.11 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2285  hypothetical protein  27.89 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.272094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1656  extensin family protein  25.44 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.281321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0828  hypothetical protein  37.11 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2264  extensin family protein  29.87 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.51352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2456  hypothetical protein  28.95 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4933  Extensin family protein  30.27 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.895839  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0961  extensin family protein  27.21 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0112544  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2397  extensin family protein  30.14 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0878  Extensin family protein  28.19 
 
 
329 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0917  extensin family protein  28.19 
 
 
329 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3270  hypothetical protein  26.92 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2463  Extensin family protein  28.93 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0760  extensin-like  29.03 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2180  Extensin family protein  28.4 
 
 
436 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915036  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2297  extensin family protein  29.08 
 
 
280 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.261426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1611  extensin family protein  29.79 
 
 
390 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.22002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3080  Extensin family protein  27.14 
 
 
316 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0618  extensin-like protein  30.28 
 
 
293 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568145  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2814  Extensin family protein  30 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52695  normal  0.0111316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1166  extensin-like protein  27.7 
 
 
343 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0482  Extensin family protein  32.63 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2474  extensin family protein  26.98 
 
 
361 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.662773  normal  0.0514896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1268  extensin-like  27.47 
 
 
319 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0445  Extensin family protein  31.58 
 
 
305 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0012  extensin family protein  36.17 
 
 
265 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4292  extensin-like  27.03 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0017  Extensin family protein  32.98 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2107  extensin family protein  32.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.271433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0412  extensin family protein  31.58 
 
 
305 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.531643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3302  Extensin family protein  27.74 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000699012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>