84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1509 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1509  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1459  hypothetical protein  99.67 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1656  extensin family protein  83.5 
 
 		 309 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.281321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1611  extensin family protein  63.08 
 
 		 390 aa  261  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.22002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2463  Extensin family protein  47.13 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2180  Extensin family protein  59.14 
 
 		 436 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915036  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2121  extensin-like  56.02 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2935  extensin family protein  41.44 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3080  Extensin family protein  40.31 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2814  Extensin family protein  40.82 
 
 		 338 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52695  normal  0.0111316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0445  Extensin family protein  37.78 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264041  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0482  Extensin family protein  38.12 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0412  extensin family protein  34.11 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.531643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2297  extensin family protein  35.36 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.261426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2474  extensin family protein  34.17 
 
 		 361 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.662773  normal  0.0514896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2120  extensin-like  35.91 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3270  hypothetical protein  36.67 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1728  extensin family protein  35.87 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4063  Extensin family protein  42.55 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0950  extensin family protein  40.76 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00924534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3408  extensin-like  40.43 
 
 		 415 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0393857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0760  extensin-like  37.23 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2885  extensin-like  41.84 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1978  extensin-like protein  40.43 
 
 		 402 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0618  extensin-like protein  43.57 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4292  extensin-like  37.16 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4933  Extensin family protein  35.33 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.895839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2944  hypothetical protein  38.67 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0362453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2178  extensin-like  40.43 
 
 		 393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1300  Extensin family protein  38.22 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0538654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6195  hypothetical protein  41.91 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2458  extensin-like protein  39.72 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480313  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1268  extensin-like  34.43 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2285  hypothetical protein  36.42 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.272094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1166  extensin-like protein  37.75 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0961  extensin family protein  35.76 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0112544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0017  Extensin family protein  34.25 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3714  Extensin family protein  33.33 
 
 		 341 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0977597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2211  extensin family protein  36.88 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2264  extensin family protein  41.4 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3312  extensin family protein  35.23 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2456  hypothetical protein  34.24 
 
 		 403 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0853  Extensin family protein  39.49 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0878  Extensin family protein  39.49 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0012  extensin family protein  34.41 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0917  extensin family protein  39.49 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0664  extensin-like protein  34.55 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0161658  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2107  extensin family protein  31.89 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.271433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0618  extensin-like protein  29.17 
 
 		 233 aa  95.9  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1323  extensin-like, C-terminal  30.56 
 
 		 229 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1511  extensin family protein  28.16 
 
 		 229 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1036  hypothetical protein  32.34 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.507512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1513  hypothetical protein  31.67 
 
 		 229 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2099  extensin-like  38.35 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4211  extensin family protein  28.14 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0848  extensin family protein  29.78 
 
 		 250 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846285  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4106  extensin family protein  28.14 
 
 		 224 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1116  extensin family protein  27.54 
 
 		 229 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.822748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0871  extensin family protein  36.29 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3988  Extensin family protein  30.33 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1661  extensin-like  36.67 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3302  Extensin family protein  30.6 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000699012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1075  extensin-like protein  30.41 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1329  extensin family protein  32.67 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000197088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39250  hypothetical protein  29.63 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.926206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0656  extensin-like protein  30.14 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1529  extensin family protein  29.32 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1458  hypothetical protein  27.92 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3354  extensin family protein  27.51 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2133  Extensin family protein  28.48 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16750  hypothetical protein  25.41 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1846  Extensin family protein  28.3 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2632  Extensin family protein  32.19 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0435  extensin family protein  25.6 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.250587  normal  0.722758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0416  extensin family protein  26.04 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.039065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0417  extensin family protein  25.6 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.599448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0423  extensin family protein  25.6 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.933348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0851  extensin family protein  26.39 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.223472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0477  extensin family protein  25.6 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2770  extensin-like  28.06 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2397  extensin family protein  26.62 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0828  hypothetical protein  24.68 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0822  hypothetical protein  24.68 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6683  hypothetical protein  26.86 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>