More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1003 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4476  peptidase U32  93.23 
 
 		 325 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4326  peptidase U32  92.92 
 
 		 325 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1003  peptidase U32  100 
 
 		 325 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4779  peptidase U32  84.31 
 
 		 325 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4228  peptidase U32  62.42 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2117  peptidase U32  63.19 
 
 		 326 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.871657  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2386  peptidase U32  62.58 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6298  peptidase U32  62.15 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0290  U32 family peptidase  62.46 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0465  putative protease  62.88 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3116  peptidase U32  61.85 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0266  U32 family peptidase  62.15 
 
 		 325 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4296  peptidase U32  58.72 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3005  peptidase U32  58.1 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2525  peptidase U32  56.44 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3475  peptidase U32  56.57 
 
 		 331 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2401  peptidase U32  53.05 
 
 		 333 aa  358  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2131  U32 family peptidase  47.9 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.534067  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1034  peptidase U32  47.13 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0183  putative protease  47.35 
 
 		 337 aa  325  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03867  putative protease  45.18 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0717  peptidase U32  46.08 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2136  peptidase U32  46.83 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2345  peptidase U32  50 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307573  hitchhiker  0.0000186625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2723  peptidase, U32 family  50 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03388  protease  46.18 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0136  peptidase U32  47.29 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13290  putative protease  46.22 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.332968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1195  putative protease  46.22 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3098  peptidase U32  47.31 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0469938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002618  putative protease  46.18 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0605  putative peptidase  45.54 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0109  peptidase U32  46.06 
 
 		 335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3463  peptidase, U32 family  45.51 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3629  peptidase, U32 family  45.51 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3532  peptidase, U32 family  45.51 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3569  peptidase, U32 family  45.51 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3614  peptidase, U32 family  46.2 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3461  peptidase, U32 family  45.21 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4664  peptidase U32  47.6 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3587  peptidase U32  47.6 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.858061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03025  predicted peptidase (collagenase-like)  45.51 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0547  peptidase U32  45.51 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02976  hypothetical protein  45.51 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0594  peptidase U32  45.21 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3454  U32 family peptidase  45.62 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0540  peptidase U32  45.62 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2805  peptidase U32  44.74 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4477  peptidase, U32 family  45.51 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3350  U32 family peptidase  45.62 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3640  U32 family peptidase  45.62 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0818  peptidase U32  45.21 
 
 		 331 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.66707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2573  peptidase U32  47.43 
 
 		 348 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3220  peptidase U32  47.13 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3337  peptidase U32  45.21 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1789  peptidase U32  47.31 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2186  putative protease  45.92 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3456  peptidase U32  45.37 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.404335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3350  peptidase U32  44.74 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3196  peptidase U32  44.05 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4940  peptidase U32  48.95 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2113  peptidase U32  46.71 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.404361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3582  U32 family peptidase  44.91 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5060  peptidase U32  48.18 
 
 		 342 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3715  peptidase U32  44.91 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4010  U32 family peptidase  44.91 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3202  peptidase U32  43.45 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1061  peptidase U32  44.44 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1133  peptidase U32  44.64 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0867416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1249  U32 family peptidase  44.35 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1171  peptidase U32  43.15 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1039  peptidase U32  44.64 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3516  peptidase U32  44.14 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0998  U32 family peptidase  45.24 
 
 		 333 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3340  peptidase U32  43.45 
 
 		 336 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1470  peptidase U32  46.2 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0888576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1065  peptidase U32  44.35 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1014  peptidase U32  44.14 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3019  peptidase U32  42.86 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1804  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2692  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2814  hypothetical protein  44.71 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3595  peptidase U32  45.62 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.04534 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2749  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0623  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2389  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1704  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2898  U32 family peptidase  44.71 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2787  peptidase U32  43.24 
 
 		 333 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0504  peptidase U32  45.21 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02301  protease protein  47.6 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0826  peptidase U32  43.81 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264968  normal  0.486585 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  33.56 
 
 		 835 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  31.34 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  34.01 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  33.22 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  30.14 
 
 		 471 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  30.85 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  32.21 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  32.08 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>