More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4228 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4228  peptidase U32  100 
 
 		 331 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2386  peptidase U32  75.23 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2117  peptidase U32  74.62 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.871657  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0465  putative protease  74.32 
 
 		 326 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1003  peptidase U32  62.42 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4326  peptidase U32  62.73 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4476  peptidase U32  62.12 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4779  peptidase U32  64.24 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6298  peptidase U32  62.42 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3116  peptidase U32  60.61 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4296  peptidase U32  62.95 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3005  peptidase U32  60.84 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0266  U32 family peptidase  61.52 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0290  U32 family peptidase  61.21 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2401  peptidase U32  56.76 
 
 		 333 aa  368  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2525  peptidase U32  58.61 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3475  peptidase U32  56.63 
 
 		 331 aa  358  7e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0717  peptidase U32  52.23 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0109  peptidase U32  51.64 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1034  peptidase U32  51.79 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2136  peptidase U32  51.19 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2186  putative protease  51.19 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1789  peptidase U32  52.38 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3587  peptidase U32  53.27 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.858061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2573  peptidase U32  52.84 
 
 		 348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3220  peptidase U32  52.84 
 
 		 348 aa  328  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4664  peptidase U32  53.27 
 
 		 338 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0136  peptidase U32  50.89 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03867  putative protease  49.26 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2787  peptidase U32  47.62 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2113  peptidase U32  52.08 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.404361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2692  U32 family peptidase  51.48 
 
 		 344 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1804  U32 family peptidase  51.19 
 
 		 344 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0623  U32 family peptidase  51.48 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2749  U32 family peptidase  51.48 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2814  hypothetical protein  51.48 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2389  U32 family peptidase  51.48 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2898  U32 family peptidase  51.48 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1704  U32 family peptidase  51.48 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2723  peptidase, U32 family  52.1 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2345  peptidase U32  52.1 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307573  hitchhiker  0.0000186625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03388  protease  47.8 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3202  peptidase U32  46.31 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3196  peptidase U32  46.61 
 
 		 336 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3019  peptidase U32  46.61 
 
 		 333 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1171  peptidase U32  46.31 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002618  putative protease  47.93 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1014  peptidase U32  46.61 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1470  peptidase U32  51.2 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0888576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0605  putative peptidase  48.22 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0183  putative protease  47.63 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4940  peptidase U32  54.93 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2805  peptidase U32  46.73 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1133  peptidase U32  46.13 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0867416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1039  peptidase U32  45.83 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3516  peptidase U32  46.02 
 
 		 333 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5060  peptidase U32  54.63 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3350  peptidase U32  45.83 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1061  peptidase U32  45.83 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3098  peptidase U32  48.38 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0469938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3340  peptidase U32  45.72 
 
 		 336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1249  U32 family peptidase  44.94 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1065  peptidase U32  45.54 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0998  U32 family peptidase  46.31 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4010  U32 family peptidase  47.92 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3582  U32 family peptidase  47.92 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3715  peptidase U32  47.92 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0826  peptidase U32  48.08 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264968  normal  0.486585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2131  U32 family peptidase  46.61 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.534067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3614  peptidase, U32 family  47.45 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3454  U32 family peptidase  46.73 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0540  peptidase U32  46.73 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3640  U32 family peptidase  46.73 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3350  U32 family peptidase  46.73 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0547  peptidase U32  46.73 
 
 		 331 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03025  predicted peptidase (collagenase-like)  46.73 
 
 		 331 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4477  peptidase, U32 family  46.73 
 
 		 331 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02976  hypothetical protein  46.73 
 
 		 331 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3629  peptidase, U32 family  47.32 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3569  peptidase, U32 family  47.32 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3463  peptidase, U32 family  47.32 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3532  peptidase, U32 family  47.32 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3461  peptidase, U32 family  47.32 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13290  putative protease  47.92 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.332968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1195  putative protease  47.92 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0818  peptidase U32  45.72 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.66707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0594  peptidase U32  45.43 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3337  peptidase U32  45.83 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3456  peptidase U32  46.59 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.404335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0504  peptidase U32  48.21 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02301  protease protein  51.79 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3595  peptidase U32  46.73 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.04534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.33 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.33 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.67 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  38.03 
 
 		 430 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  35.55 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  34.45 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  36.27 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  33.54 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>