More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3715 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4010  U32 family peptidase  100 
 
 		 331 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3715  peptidase U32  100 
 
 		 331 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3582  U32 family peptidase  100 
 
 		 331 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03025  predicted peptidase (collagenase-like)  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0547  peptidase U32  88.52 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3454  U32 family peptidase  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0540  peptidase U32  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02976  hypothetical protein  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3640  U32 family peptidase  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4477  peptidase, U32 family  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3350  U32 family peptidase  88.82 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3461  peptidase, U32 family  89.12 
 
 		 331 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3532  peptidase, U32 family  89.43 
 
 		 331 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3629  peptidase, U32 family  89.43 
 
 		 331 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3463  peptidase, U32 family  89.43 
 
 		 331 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3569  peptidase, U32 family  89.43 
 
 		 331 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3614  peptidase, U32 family  88.52 
 
 		 326 aa  617  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3456  peptidase U32  88.86 
 
 		 332 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.404335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0818  peptidase U32  87.31 
 
 		 331 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.66707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0594  peptidase U32  87.01 
 
 		 331 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3595  peptidase U32  90.33 
 
 		 331 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.04534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0504  peptidase U32  90.63 
 
 		 331 aa  600  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3337  peptidase U32  85.8 
 
 		 331 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2131  U32 family peptidase  74.92 
 
 		 331 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.534067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03388  protease  73.89 
 
 		 337 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002618  putative protease  74.48 
 
 		 337 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0605  putative peptidase  72.07 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0183  putative protease  73.29 
 
 		 337 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3098  peptidase U32  64.65 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0469938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2136  peptidase U32  65.26 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03867  putative protease  64.56 
 
 		 332 aa  457  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1195  putative protease  62.54 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13290  putative protease  62.54 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.332968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2692  U32 family peptidase  61.93 
 
 		 344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0623  U32 family peptidase  61.63 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2814  hypothetical protein  61.93 
 
 		 344 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2389  U32 family peptidase  61.63 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1804  U32 family peptidase  61.33 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1704  U32 family peptidase  61.63 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2898  U32 family peptidase  61.63 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2749  U32 family peptidase  61.93 
 
 		 344 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1061  peptidase U32  62.46 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0136  peptidase U32  61.14 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3350  peptidase U32  61.56 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2805  peptidase U32  62.46 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1133  peptidase U32  62.46 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0867416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1249  U32 family peptidase  61.86 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3516  peptidase U32  60.96 
 
 		 333 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2787  peptidase U32  60.66 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1065  peptidase U32  61.86 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2573  peptidase U32  60.42 
 
 		 348 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3220  peptidase U32  60.42 
 
 		 348 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1039  peptidase U32  61.26 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3019  peptidase U32  60.06 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1014  peptidase U32  60.66 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0998  U32 family peptidase  59.76 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1171  peptidase U32  60.42 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3340  peptidase U32  60.42 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3202  peptidase U32  60.71 
 
 		 336 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3196  peptidase U32  60.71 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1034  peptidase U32  58.88 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0717  peptidase U32  57.83 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2186  putative protease  56.8 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0109  peptidase U32  56.36 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1470  peptidase U32  57.27 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0888576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2345  peptidase U32  56.97 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307573  hitchhiker  0.0000186625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2723  peptidase, U32 family  56.97 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1789  peptidase U32  52.57 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2113  peptidase U32  52.87 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.404361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3587  peptidase U32  52.87 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.858061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0826  peptidase U32  53.78 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264968  normal  0.486585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4664  peptidase U32  52.87 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5060  peptidase U32  56.06 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02301  protease protein  53.17 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4940  peptidase U32  52.73 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2401  peptidase U32  46.83 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3475  peptidase U32  47.13 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4326  peptidase U32  46.39 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3116  peptidase U32  47.43 
 
 		 325 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0290  U32 family peptidase  48.94 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0266  U32 family peptidase  48.94 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4476  peptidase U32  45.48 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1003  peptidase U32  44.91 
 
 		 325 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4228  peptidase U32  47.92 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2386  peptidase U32  47.01 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6298  peptidase U32  45.32 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2525  peptidase U32  48.8 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4779  peptidase U32  45.78 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3005  peptidase U32  47.29 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4296  peptidase U32  45.92 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2117  peptidase U32  46.41 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.871657  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0465  putative protease  46.11 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  36.08 
 
 		 439 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.33 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  34.26 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.07 
 
 		 409 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.07 
 
 		 409 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  34.74 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  31.68 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  35.03 
 
 		 810 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>