More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1470 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1470  peptidase U32  100 
 
 		 336 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0888576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2573  peptidase U32  66.37 
 
 		 348 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3220  peptidase U32  66.08 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2692  U32 family peptidase  66.27 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1804  U32 family peptidase  66.57 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0136  peptidase U32  66.47 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027023  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0623  U32 family peptidase  66.27 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2814  hypothetical protein  65.77 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2898  U32 family peptidase  66.27 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2389  U32 family peptidase  66.27 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2749  U32 family peptidase  65.77 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1704  U32 family peptidase  66.27 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0717  peptidase U32  63.61 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0109  peptidase U32  63.75 
 
 		 335 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2186  putative protease  63.25 
 
 		 333 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2113  peptidase U32  60.96 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.404361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3587  peptidase U32  61.82 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.858061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1789  peptidase U32  60.96 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4664  peptidase U32  61.82 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1195  putative protease  60.91 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2723  peptidase, U32 family  60.12 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13290  putative protease  60.91 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.332968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2345  peptidase U32  60.12 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307573  hitchhiker  0.0000186625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3098  peptidase U32  58.48 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0469938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4940  peptidase U32  63.14 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5060  peptidase U32  62.54 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2136  peptidase U32  59.39 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4010  U32 family peptidase  57.27 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3582  U32 family peptidase  57.27 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3715  peptidase U32  57.27 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02301  protease protein  61.65 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0183  putative protease  55.95 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03025  predicted peptidase (collagenase-like)  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0547  peptidase U32  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1034  peptidase U32  57.58 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.159666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4477  peptidase, U32 family  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0540  peptidase U32  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02976  hypothetical protein  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3350  U32 family peptidase  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3454  U32 family peptidase  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3614  peptidase, U32 family  56.84 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3640  U32 family peptidase  56.67 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0605  putative peptidase  54.52 
 
 		 333 aa  384  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3629  peptidase, U32 family  56.36 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3532  peptidase, U32 family  56.36 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03388  protease  55.65 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3461  peptidase, U32 family  56.36 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3463  peptidase, U32 family  56.36 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3569  peptidase, U32 family  56.36 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002618  putative protease  55.36 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0594  peptidase U32  55.76 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2131  U32 family peptidase  53.94 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.534067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0818  peptidase U32  55.76 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.66707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03867  putative protease  55.59 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3456  peptidase U32  55.29 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.404335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3337  peptidase U32  55.45 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3595  peptidase U32  56.36 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.04534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1014  peptidase U32  53.01 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0504  peptidase U32  55.76 
 
 		 331 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1039  peptidase U32  53.01 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3350  peptidase U32  52.41 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1061  peptidase U32  51.51 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1133  peptidase U32  51.51 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0867416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3516  peptidase U32  51.81 
 
 		 333 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0998  U32 family peptidase  53.31 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1249  U32 family peptidase  50.9 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3019  peptidase U32  50.6 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1065  peptidase U32  51.2 
 
 		 333 aa  352  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2805  peptidase U32  50.9 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1171  peptidase U32  51.04 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3196  peptidase U32  50.75 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3202  peptidase U32  50.75 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3340  peptidase U32  50.45 
 
 		 336 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2787  peptidase U32  49.4 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2401  peptidase U32  51.05 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0826  peptidase U32  49.39 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264968  normal  0.486585 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3475  peptidase U32  50.15 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3005  peptidase U32  52.28 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4228  peptidase U32  51.2 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4296  peptidase U32  50.6 
 
 		 332 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3116  peptidase U32  48.63 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4326  peptidase U32  46.81 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1003  peptidase U32  46.2 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2117  peptidase U32  48.48 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.871657  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2386  peptidase U32  48.18 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4476  peptidase U32  45.59 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6298  peptidase U32  48.02 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0465  putative protease  48.18 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0290  U32 family peptidase  48.63 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0266  U32 family peptidase  48.63 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4779  peptidase U32  47.42 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2525  peptidase U32  47.6 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.44 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  35.49 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  34.01 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  32.54 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  32.54 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  34.78 
 
 		 886 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  34.25 
 
 		 783 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  32.8 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>