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for query gene Rmar_1066 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1066  Amidase  100 
 
 		 566 aa  1154    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.271533  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6324  Amidase  52.21 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2854  amidase  43.27 
 
 		 596 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1111  amidase  39.96 
 
 		 583 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.294347 
 
 
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NC_009484  Acry_0616  amidase  37.27 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0507  amidase  39.92 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
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NC_007760  Adeh_3928  amidase  40.99 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0519913  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.61 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.65 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_4068  Amidase  40.92 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.39 
 
 		 485 aa  223  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_4036  Amidase  40.92 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  32.26 
 
 		 486 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.46 
 
 		 486 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.36 
 
 		 485 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.59 
 
 		 485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 486 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  33.26 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.13 
 
 		 484 aa  210  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.87 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  33.54 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.11 
 
 		 489 aa  203  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.47 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.25 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.19 
 
 		 466 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
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NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.67 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.06 
 
 		 485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  32.92 
 
 		 475 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.8 
 
 		 485 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_4286  amidase  32.3 
 
 		 466 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508501  normal  0.0108693 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.77 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.29 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal  1 
 
 
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NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 		 486 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.27 
 
 		 475 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.94 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.52 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.5 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.88 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.38 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.05 
 
 		 463 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.11 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.25 
 
 		 486 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.75 
 
 		 498 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.06 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.28 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2947  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.8 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_1951  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.31 
 
 		 490 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.759727 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.45 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0332  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.96 
 
 		 483 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124108  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_0258  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.51 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.98 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
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NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.19 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.78 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
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NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 		 483 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.36 
 
 		 499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1360  amidase  32.52 
 
 		 466 aa  183  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
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NC_007298  Daro_0118  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.27 
 
 		 485 aa  183  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0373  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.64 
 
 		 487 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0268901  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.7 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_12630  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.04 
 
 		 483 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.25 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1245  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.18 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  29.12 
 
 		 486 aa  179  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.77 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
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NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.54 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.95 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
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NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.07 
 
 		 485 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.56 
 
 		 483 aa  179  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.07 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0167  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.93 
 
 		 484 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.98 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.74 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.87 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.22 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 		 479 aa  177  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0353  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.16 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0289  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.98 
 
 		 483 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0458  Amidase  28.25 
 
 		 549 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.6 
 
 		 482 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4953  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0367  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.79 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
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NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.92 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0350  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.281052 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0301  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0394  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_4294  amidase  32.71 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
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NC_008789  Hhal_1003  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.67 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0306  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0321  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.84 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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