More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2854 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2854  amidase  100 
 
 
596 aa  1208    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1111  amidase  46.18 
 
 
583 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.294347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6324  Amidase  43.4 
 
 
555 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1066  Amidase  43.27 
 
 
566 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.271533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0616  amidase  40.89 
 
 
547 aa  346  7e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  36.07 
 
 
466 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0507  amidase  42.89 
 
 
481 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3928  amidase  40.65 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0519913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4036  Amidase  40.42 
 
 
491 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4068  Amidase  40 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.33 
 
 
470 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  34.69 
 
 
475 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.98 
 
 
494 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.2 
 
 
470 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.52 
 
 
486 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.72 
 
 
485 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.02 
 
 
489 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1438  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.5 
 
 
485 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.46 
 
 
486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.12 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  32.72 
 
 
466 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.8 
 
 
491 aa  186  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1955  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.71 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1989  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.71 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  38.54 
 
 
463 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.91 
 
 
486 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.47 
 
 
484 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.21 
 
 
485 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5308  amidase  33.97 
 
 
466 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.72 
 
 
486 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  33.89 
 
 
534 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.58 
 
 
491 aa  180  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.72 
 
 
485 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.86 
 
 
484 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.16 
 
 
479 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.92 
 
 
486 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.86 
 
 
484 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.83 
 
 
483 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4286  amidase  32.18 
 
 
466 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508501  normal  0.0108693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.44 
 
 
491 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.41 
 
 
485 aa  177  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.25 
 
 
483 aa  177  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.25 
 
 
483 aa  177  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.56 
 
 
463 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.29 
 
 
486 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.49 
 
 
485 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.42 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.82 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.6 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.72 
 
 
490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 
497 aa  174  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4294  amidase  34.2 
 
 
466 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.7 
 
 
483 aa  174  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
485 aa  173  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.81 
 
 
483 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 
483 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.54 
 
 
489 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.01 
 
 
483 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  30.8 
 
 
473 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.55 
 
 
484 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.84 
 
 
500 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0373  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.56 
 
 
487 aa  170  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2296  amidase  30.85 
 
 
456 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.63 
 
 
487 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4623  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.16 
 
 
491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0332  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.84 
 
 
483 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124108  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  28.17 
 
 
491 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  37.75 
 
 
542 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.92 
 
 
486 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0938  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.62 
 
 
483 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.63 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  28.49 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  29.16 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.86 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  28.17 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.44 
 
 
482 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.49 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0931  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.22 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.77 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  33.07 
 
 
463 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.15 
 
 
483 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  28.09 
 
 
491 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  27.91 
 
 
491 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.67 
 
 
482 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.87 
 
 
475 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  28.51 
 
 
491 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4284  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.22 
 
 
483 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  28.95 
 
 
491 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  28.95 
 
 
491 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.63 
 
 
499 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.26 
 
 
463 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  30.02 
 
 
549 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.93 
 
 
475 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0703  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.16 
 
 
487 aa  161  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  32.04 
 
 
461 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.23 
 
 
483 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.17 
 
 
475 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.09 
 
 
498 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  28.17 
 
 
491 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>