223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6222 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4388  Hydantoinase B/oxoprolinase  59.11 
 
 
590 aa  643    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6222  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
598 aa  1226    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3074  hydantoinase B/oxoprolinase  63.73 
 
 
589 aa  758    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0473  hydantoinase B/oxoprolinase  63.46 
 
 
588 aa  732    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2294  Hydantoinase B/oxoprolinase  59.8 
 
 
598 aa  700    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0453  Hydantoinase B/oxoprolinase  52.94 
 
 
579 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.53499  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0136  Hydantoinase B/oxoprolinase  49.14 
 
 
586 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4225  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.4 
 
 
588 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237131  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.58 
 
 
548 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.81 
 
 
548 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.72 
 
 
582 aa  200  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.26 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.24 
 
 
634 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.88 
 
 
580 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  27.82 
 
 
581 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  27.65 
 
 
581 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 
577 aa  191  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  27.13 
 
 
581 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.37 
 
 
577 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 
586 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.22 
 
 
651 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.65 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.96 
 
 
616 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  25.74 
 
 
640 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.5 
 
 
588 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.48 
 
 
582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.45 
 
 
681 aa  163  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.5 
 
 
530 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.13 
 
 
657 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.52 
 
 
515 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.81 
 
 
601 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.18 
 
 
519 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.33 
 
 
527 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  27.15 
 
 
579 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.91 
 
 
519 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  25.29 
 
 
674 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.63 
 
 
660 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.68 
 
 
594 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.1 
 
 
670 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.25 
 
 
1203 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7017  hydantoin utilization protein  26.42 
 
 
571 aa  142  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  25.6 
 
 
537 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.12 
 
 
585 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.24 
 
 
587 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.72 
 
 
1258 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.8 
 
 
558 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.41 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.33 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.09 
 
 
556 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.41 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.75 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.16 
 
 
775 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.39 
 
 
1218 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.17 
 
 
1190 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  26.51 
 
 
574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.96 
 
 
597 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.32 
 
 
1206 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.31 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.23 
 
 
1229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.85 
 
 
1205 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.43 
 
 
564 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  26.24 
 
 
589 aa  131  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.85 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  24.62 
 
 
647 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3306  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.62 
 
 
561 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32832  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.83 
 
 
564 aa  130  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.93 
 
 
1212 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2207  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.72 
 
 
559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00887256  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  25.46 
 
 
1203 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  26.16 
 
 
600 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  26.27 
 
 
671 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25 
 
 
1206 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  24.22 
 
 
1218 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.01 
 
 
1245 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.44593 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00950  cytoplasm protein, putative  25.36 
 
 
1311 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.33 
 
 
524 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  24.49 
 
 
1224 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.74 
 
 
534 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.56 
 
 
512 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.83 
 
 
1206 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.74 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.3 
 
 
598 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
1307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.66 
 
 
1210 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.52 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  24.08 
 
 
1209 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.33 
 
 
541 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.44 
 
 
529 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  25.23 
 
 
1198 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.52 
 
 
1229 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.65 
 
 
1293 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.58 
 
 
1217 aa  120  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.37 
 
 
568 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  26.27 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.03 
 
 
1226 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.23 
 
 
1215 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0219304 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.29 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  24.58 
 
 
585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.17 
 
 
652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  25.36 
 
 
566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>