223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6273 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
634 aa  1310    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.32 
 
 
651 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  30.8 
 
 
581 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  31.53 
 
 
581 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  30.67 
 
 
581 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.46 
 
 
588 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.87 
 
 
578 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  32.13 
 
 
548 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.82 
 
 
582 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.33 
 
 
548 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.05 
 
 
681 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.25 
 
 
564 aa  252  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.75 
 
 
577 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  30.66 
 
 
566 aa  251  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.07 
 
 
582 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.3 
 
 
577 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
657 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0136  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.4 
 
 
586 aa  240  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.53 
 
 
534 aa  239  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.81 
 
 
575 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.49 
 
 
541 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.19 
 
 
515 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.38 
 
 
562 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.03 
 
 
531 aa  229  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.1 
 
 
586 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.73 
 
 
616 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 
580 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4225  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.91 
 
 
588 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237131  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.47 
 
 
519 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.46 
 
 
524 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.54 
 
 
529 aa  224  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.77 
 
 
597 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.26 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2294  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.96 
 
 
598 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.1 
 
 
530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3074  hydantoinase B/oxoprolinase  30.22 
 
 
589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  29.47 
 
 
600 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  30.46 
 
 
565 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.95 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.42 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.06 
 
 
598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.6 
 
 
577 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  27.37 
 
 
640 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6222  hydantoinase B/oxoprolinase  29.24 
 
 
598 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.1 
 
 
589 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  29.22 
 
 
585 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  30.58 
 
 
563 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.8 
 
 
564 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  29.8 
 
 
551 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.26 
 
 
556 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.94 
 
 
601 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.76 
 
 
589 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.5 
 
 
582 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  31.59 
 
 
845 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.85 
 
 
587 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.55 
 
 
594 aa  204  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.28 
 
 
539 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.49 
 
 
579 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  31.63 
 
 
537 aa  203  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  28.32 
 
 
674 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.54 
 
 
511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.38 
 
 
660 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3306  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.24 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32832  normal  0.98941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 
583 aa  197  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.11 
 
 
629 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  29.98 
 
 
558 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.79 
 
 
585 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.98 
 
 
558 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  28.09 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0453  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.85 
 
 
579 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.53499  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.52 
 
 
514 aa  188  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.3 
 
 
597 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.77 
 
 
517 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  28.18 
 
 
574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.48 
 
 
775 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.97 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1105  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 
568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304124 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7017  hydantoin utilization protein  29.07 
 
 
571 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  25.62 
 
 
647 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.62 
 
 
626 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 
624 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.17 
 
 
645 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.28 
 
 
1226 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.58 
 
 
584 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.38 
 
 
515 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.04 
 
 
521 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.94 
 
 
599 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.47 
 
 
572 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.76 
 
 
514 aa  181  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03972  5-oxo-L-prolinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14330)  27.5 
 
 
1274 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.574079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.65 
 
 
513 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.54 
 
 
561 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.7 
 
 
561 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.96 
 
 
517 aa  179  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 
708 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 
708 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.44 
 
 
1206 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  27.6 
 
 
1277 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.34 
 
 
645 aa  177  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.54 
 
 
544 aa  177  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>