More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0378 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03972  5-oxo-L-prolinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14330)  42.14 
 
 
1274 aa  942    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.574079 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08779  conserved hypothetical protein  40.73 
 
 
1322 aa  884    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.772527 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  40.39 
 
 
1307 aa  903    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0738  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.11 
 
 
1279 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  43.5 
 
 
1271 aa  959    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.44 
 
 
1229 aa  1439    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  57.1 
 
 
1198 aa  1390    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00950  cytoplasm protein, putative  39.05 
 
 
1311 aa  879    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6440  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  47.06 
 
 
1220 aa  1001    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1380  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.57 
 
 
1239 aa  1387    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.11 
 
 
1245 aa  1332    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.44593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.67 
 
 
1212 aa  1452    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0735319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  62.85 
 
 
1212 aa  1526    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.65 
 
 
1258 aa  1513    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2245  hydantoinase B/oxoprolinase  66.54 
 
 
518 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2246  hydantoinase/oxoprolinase  53.19 
 
 
698 aa  752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0794287  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
1226 aa  2523    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_42276  predicted protein  43.81 
 
 
1263 aa  936    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.15 
 
 
1222 aa  1415    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.89 
 
 
1234 aa  1032    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2574  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.36 
 
 
1216 aa  1435    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86944  5-oxoprolinase  39.5 
 
 
1322 aa  852    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0999  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.21 
 
 
1228 aa  914    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1358  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.57 
 
 
1231 aa  916    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.99 
 
 
1215 aa  933    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0219304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.77 
 
 
1229 aa  1321    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.15 
 
 
698 aa  744    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.438874  hitchhiker  0.00293366 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  57.34 
 
 
1203 aa  1401    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.06 
 
 
1242 aa  1490    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.78 
 
 
1220 aa  1470    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2566  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.88 
 
 
1185 aa  1424    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4282  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.98 
 
 
1253 aa  821    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874898  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.58 
 
 
1210 aa  1483    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2480  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.57 
 
 
1250 aa  1386    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.020178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  62.63 
 
 
1213 aa  1501    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.85 
 
 
1206 aa  1414    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81320  5-oxoprolinase  42.13 
 
 
1309 aa  912    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.71 
 
 
1211 aa  1487    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  64.19 
 
 
515 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.39 
 
 
1229 aa  1410    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.94 
 
 
1218 aa  1447    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  58.02 
 
 
1209 aa  1409    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  64.19 
 
 
515 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.16 
 
 
1213 aa  1409    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.17 
 
 
1212 aa  1386    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  39.42 
 
 
1319 aa  867    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.92 
 
 
1217 aa  1387    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.47 
 
 
1206 aa  1427    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.19 
 
 
1382 aa  849    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3295  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.56 
 
 
1220 aa  1417    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.36 
 
 
1206 aa  1406    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.52 
 
 
1203 aa  1436    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.48 
 
 
1293 aa  1303    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  57.85 
 
 
1218 aa  1398    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.8 
 
 
519 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.39 
 
 
1205 aa  1424    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1019  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.09 
 
 
1331 aa  971    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3461  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.9 
 
 
1212 aa  1440    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397296  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.49 
 
 
1190 aa  1153    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5284  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.73 
 
 
1212 aa  1435    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415558  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1233  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.15 
 
 
698 aa  746    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3552  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  62.01 
 
 
1212 aa  1462    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.03 
 
 
1230 aa  978    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  46.16 
 
 
1224 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.71 
 
 
694 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.34 
 
 
1225 aa  1261    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  46.67 
 
 
582 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05320  5-oxoprolinase, putative  47.95 
 
 
576 aa  475  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02650  cytoplasm protein, putative  35.16 
 
 
763 aa  466  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213568  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05310  5-oxoprolinase, putative  35.89 
 
 
758 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.72 
 
 
527 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.17 
 
 
519 aa  406  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  30.85 
 
 
1277 aa  403  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.27 
 
 
524 aa  400  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.27 
 
 
512 aa  390  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  38.09 
 
 
660 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.64 
 
 
528 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.48 
 
 
515 aa  379  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41 
 
 
534 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.36 
 
 
531 aa  363  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  27.66 
 
 
1355 aa  358  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.34 
 
 
515 aa  353  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  27.2 
 
 
1362 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.2 
 
 
511 aa  346  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  43.24 
 
 
537 aa  344  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.64 
 
 
541 aa  343  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.13 
 
 
575 aa  333  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.77 
 
 
691 aa  333  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.17 
 
 
701 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.22 
 
 
657 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.7 
 
 
529 aa  325  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.7 
 
 
658 aa  320  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.29 
 
 
652 aa  320  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.66 
 
 
663 aa  317  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.91 
 
 
510 aa  314  6.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.65 
 
 
513 aa  313  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.84 
 
 
580 aa  312  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.48 
 
 
692 aa  311  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.91 
 
 
707 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.51 
 
 
539 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>