More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2123 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03972  5-oxo-L-prolinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14330)  39.83 
 
 		 1274 aa  877    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.574079 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08779  conserved hypothetical protein  39.27 
 
 		 1322 aa  806    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.772527 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  40.26 
 
 		 1307 aa  857    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86944  5-oxoprolinase  38.43 
 
 		 1322 aa  830    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3461  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.02 
 
 		 1212 aa  1512    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.54 
 
 		 515 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  54.14 
 
 		 1198 aa  1282    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00950  cytoplasm protein, putative  38.24 
 
 		 1311 aa  805    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  43 
 
 		 1271 aa  947    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  39.77 
 
 		 1319 aa  880    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.86 
 
 		 1234 aa  987    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.01 
 
 		 1225 aa  1198    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.55 
 
 		 1258 aa  1308    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2245  hydantoinase B/oxoprolinase  63.74 
 
 		 518 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2246  hydantoinase/oxoprolinase  46.23 
 
 		 698 aa  658    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0794287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.4 
 
 		 1226 aa  1365    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.06 
 
 		 1382 aa  779    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  65.94 
 
 		 1212 aa  1505    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0735319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2574  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  65.65 
 
 		 1216 aa  1501    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.48 
 
 		 698 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.438874  hitchhiker  0.00293366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0999  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.16 
 
 		 1228 aa  939    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1358  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.03 
 
 		 1231 aa  968    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.28 
 
 		 1215 aa  972    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0219304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.83 
 
 		 1229 aa  1242    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  62.54 
 
 		 1222 aa  1427    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.63 
 
 		 1206 aa  1365    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1233  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.01 
 
 		 698 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.4 
 
 		 1213 aa  1269    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2566  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.83 
 
 		 1185 aa  1247    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0738  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.1 
 
 		 1279 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  71.72 
 
 		 1217 aa  1672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.26 
 
 		 1213 aa  1616    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.26 
 
 		 1210 aa  1590    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.63 
 
 		 1212 aa  1274    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  65.22 
 
 		 1212 aa  1561    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2480  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.75 
 
 		 1250 aa  1543    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.020178 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_42276  predicted protein  41.92 
 
 		 1263 aa  897    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.9 
 
 		 1218 aa  1293    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  71.03 
 
 		 1229 aa  1628    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6440  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  47.94 
 
 		 1220 aa  970    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  59.04 
 
 		 1209 aa  1379    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  64.75 
 
 		 1211 aa  1529    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.32 
 
 		 1206 aa  1261    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.77 
 
 		 1205 aa  1325    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4282  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.54 
 
 		 1253 aa  740    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.65 
 
 		 1293 aa  1208    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  54.77 
 
 		 1218 aa  1332    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  63.6 
 
 		 519 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.95 
 
 		 694 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.97 
 
 		 1203 aa  1328    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1019  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.48 
 
 		 1331 aa  873    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81320  5-oxoprolinase  39.48 
 
 		 1309 aa  865    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.75 
 
 		 1190 aa  1154    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5284  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  65.94 
 
 		 1212 aa  1513    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3552  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.1 
 
 		 1212 aa  1510    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.8 
 
 		 1230 aa  972    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.48 
 
 		 1220 aa  1613    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1380  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  66.67 
 
 		 1239 aa  1543    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.54 
 
 		 515 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.24 
 
 		 1206 aa  1303    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.76 
 
 		 1242 aa  1437    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  54.3 
 
 		 1203 aa  1292    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.85 
 
 		 1229 aa  1273    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  47.44 
 
 		 1224 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 1245 aa  2496    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.44593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3295  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  68.44 
 
 		 1220 aa  1595    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02650  cytoplasm protein, putative  34.27 
 
 		 763 aa  446  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213568  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05310  5-oxoprolinase, putative  34.77 
 
 		 758 aa  430  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05320  5-oxoprolinase, putative  44.16 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  43.01 
 
 		 582 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.44 
 
 		 519 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.88 
 
 		 527 aa  386  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  31.27 
 
 		 1277 aa  383  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.48 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.41 
 
 		 515 aa  353  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.85 
 
 		 531 aa  350  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.97 
 
 		 512 aa  350  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.15 
 
 		 541 aa  346  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.69 
 
 		 534 aa  344  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.36 
 
 		 528 aa  343  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  42.46 
 
 		 537 aa  337  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.26 
 
 		 575 aa  337  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.23 
 
 		 515 aa  332  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  36.17 
 
 		 660 aa  331  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.23 
 
 		 691 aa  317  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.23 
 
 		 511 aa  317  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  27.1 
 
 		 1355 aa  310  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40 
 
 		 529 aa  310  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.67 
 
 		 658 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.4 
 
 		 513 aa  307  7e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  26.52 
 
 		 1362 aa  300  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  32.68 
 
 		 676 aa  299  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.42 
 
 		 707 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.6 
 
 		 692 aa  298  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.23 
 
 		 652 aa  295  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.03 
 
 		 663 aa  293  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.52 
 
 		 657 aa  292  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.29 
 
 		 539 aa  292  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.67 
 
 		 680 aa  290  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.69 
 
 		 701 aa  280  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>