More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2407 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03972  5-oxo-L-prolinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14330)  43.45 
 
 		 1274 aa  951    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.574079 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08779  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 		 1322 aa  890    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.772527 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 		 1307 aa  944    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4282  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.63 
 
 		 1253 aa  807    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.96 
 
 		 515 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  61.68 
 
 		 1198 aa  1446    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00950  cytoplasm protein, putative  40.54 
 
 		 1311 aa  894    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  46.4 
 
 		 1224 aa  1041    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_42276  predicted protein  44.91 
 
 		 1263 aa  961    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1233  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.29 
 
 		 698 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  62.9 
 
 		 1203 aa  1480    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.87 
 
 		 1258 aa  1416    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2245  hydantoinase B/oxoprolinase  63.3 
 
 		 518 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2246  hydantoinase/oxoprolinase  49.21 
 
 		 698 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0794287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.39 
 
 		 1226 aa  1411    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.37 
 
 		 1242 aa  1382    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.87 
 
 		 1234 aa  1022    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86944  5-oxoprolinase  41.05 
 
 		 1322 aa  897    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2574  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.27 
 
 		 1216 aa  1350    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.17 
 
 		 1225 aa  1207    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0999  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.27 
 
 		 1228 aa  924    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1358  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.06 
 
 		 1231 aa  973    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.26 
 
 		 1215 aa  968    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0219304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.22 
 
 		 1229 aa  1267    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.08 
 
 		 1229 aa  1362    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.26 
 
 		 1382 aa  867    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.61 
 
 		 1220 aa  1382    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  56.45 
 
 		 1209 aa  1322    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2566  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.83 
 
 		 1185 aa  1317    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.23 
 
 		 1211 aa  1403    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.58 
 
 		 1212 aa  1424    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.33 
 
 		 1213 aa  1308    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2480  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.4 
 
 		 1250 aa  1291    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.020178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.33 
 
 		 1213 aa  1418    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.96 
 
 		 515 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.83 
 
 		 1206 aa  1327    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.44 
 
 		 1245 aa  1285    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.44593 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.87 
 
 		 1218 aa  1296    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.18 
 
 		 1229 aa  1325    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81320  5-oxoprolinase  42.35 
 
 		 1309 aa  953    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.34 
 
 		 519 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3461  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.22 
 
 		 1212 aa  1344    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.73 
 
 		 1206 aa  1308    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  45.35 
 
 		 1271 aa  1015    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6440  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  47.96 
 
 		 1220 aa  981    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.99 
 
 		 1212 aa  1444    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.65 
 
 		 1212 aa  1372    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0735319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.3 
 
 		 1293 aa  1302    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  62.3 
 
 		 1218 aa  1472    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.92 
 
 		 1210 aa  1411    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.57 
 
 		 698 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.438874  hitchhiker  0.00293366 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  61.76 
 
 		 1203 aa  1457    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1019  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.35 
 
 		 1331 aa  889    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  60.76 
 
 		 1222 aa  1378    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.1 
 
 		 1190 aa  1201    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5284  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.22 
 
 		 1212 aa  1346    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3552  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.65 
 
 		 1212 aa  1375    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.03 
 
 		 1230 aa  1002    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1380  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.48 
 
 		 1239 aa  1293    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 1205 aa  2448    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.71 
 
 		 694 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0738  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.85 
 
 		 1279 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3295  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.98 
 
 		 1220 aa  1358    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.57 
 
 		 1206 aa  1464    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  41.57 
 
 		 1319 aa  926    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  59.33 
 
 		 1217 aa  1347    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05320  5-oxoprolinase, putative  47.78 
 
 		 576 aa  490  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  47.5 
 
 		 582 aa  482  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02650  cytoplasm protein, putative  37.38 
 
 		 763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213568  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05310  5-oxoprolinase, putative  37.97 
 
 		 758 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.44 
 
 		 527 aa  406  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.25 
 
 		 519 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  29.49 
 
 		 1277 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.2 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.86 
 
 		 575 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.85 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.17 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.97 
 
 		 534 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.84 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  27.93 
 
 		 1355 aa  365  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.83 
 
 		 531 aa  363  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.89 
 
 		 515 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  27.64 
 
 		 1362 aa  356  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.08 
 
 		 657 aa  354  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.52 
 
 		 511 aa  351  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.54 
 
 		 515 aa  351  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.8 
 
 		 691 aa  347  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  43.02 
 
 		 537 aa  343  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  35.94 
 
 		 660 aa  340  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.5 
 
 		 529 aa  339  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.15 
 
 		 707 aa  336  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  34.91 
 
 		 676 aa  328  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.57 
 
 		 513 aa  327  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.5 
 
 		 692 aa  327  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.48 
 
 		 663 aa  320  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.05 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.2 
 
 		 680 aa  308  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.08 
 
 		 652 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.4 
 
 		 539 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.01 
 
 		 701 aa  300  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>