222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1474 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
660 aa  1345    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  43.5 
 
 
647 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  37.54 
 
 
674 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2849  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.7 
 
 
628 aa  363  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.19 
 
 
652 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  36.21 
 
 
671 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.86 
 
 
670 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.13 
 
 
582 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.3 
 
 
577 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.2 
 
 
578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.15 
 
 
580 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.42 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.38 
 
 
597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  30.63 
 
 
566 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.92 
 
 
564 aa  252  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.83 
 
 
519 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.1 
 
 
577 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  32.39 
 
 
563 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  31.02 
 
 
640 aa  242  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.97 
 
 
657 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.1 
 
 
601 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.38 
 
 
616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.56 
 
 
534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31 
 
 
556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.18 
 
 
589 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.49 
 
 
628 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.36 
 
 
645 aa  233  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.19 
 
 
645 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.55 
 
 
632 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.28 
 
 
585 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.56 
 
 
582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.15 
 
 
561 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.18 
 
 
587 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.35 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.73 
 
 
613 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
629 aa  221  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31 
 
 
597 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.18 
 
 
562 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.78 
 
 
541 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 
558 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.87 
 
 
708 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.7 
 
 
708 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.13 
 
 
623 aa  216  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.81 
 
 
633 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.8 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  30.66 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  30.52 
 
 
611 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  30.43 
 
 
647 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  30.34 
 
 
1362 aa  214  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.8 
 
 
775 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  30.07 
 
 
1355 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.06 
 
 
624 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.69 
 
 
598 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  32.97 
 
 
537 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.42 
 
 
584 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  29.67 
 
 
585 aa  211  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.09 
 
 
681 aa  211  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.81 
 
 
579 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  30.74 
 
 
565 aa  211  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1497  hydantoinase B/oxoprolinase  30.3 
 
 
659 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00877273  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.11 
 
 
583 aa  207  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.16 
 
 
527 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.72 
 
 
515 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.48 
 
 
594 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.26 
 
 
552 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 
513 aa  204  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.63 
 
 
599 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  32.48 
 
 
577 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.49 
 
 
548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.28 
 
 
588 aa  201  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  28.4 
 
 
581 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.23 
 
 
575 aa  200  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.66 
 
 
564 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  29.24 
 
 
600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.02 
 
 
528 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  27.9 
 
 
581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  28.24 
 
 
581 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.04 
 
 
646 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.82 
 
 
589 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.5 
 
 
510 aa  193  8e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.54 
 
 
514 aa  191  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.64 
 
 
514 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.26 
 
 
544 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.83 
 
 
517 aa  188  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.1 
 
 
629 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.22 
 
 
513 aa  187  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.38 
 
 
634 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.06 
 
 
572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.17 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  31.17 
 
 
558 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.61 
 
 
581 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.48 
 
 
557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.02 
 
 
548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.98 
 
 
521 aa  184  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4046  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.14 
 
 
559 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  decreased coverage  0.00136288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.22 
 
 
582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.24 
 
 
561 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.4 
 
 
586 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31 
 
 
539 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.11 
 
 
845 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>