More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1246 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  93.05 
 
 
562 aa  838    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
845 aa  1667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  71.97 
 
 
586 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  85.82 
 
 
281 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.89 
 
 
564 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  47.79 
 
 
561 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  43.11 
 
 
565 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  45.84 
 
 
577 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.57 
 
 
561 aa  341  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1912  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.5 
 
 
569 aa  320  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.64 
 
 
577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.78 
 
 
519 aa  303  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.62 
 
 
580 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.31 
 
 
575 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.07 
 
 
527 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.84 
 
 
541 aa  282  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  36.02 
 
 
578 aa  280  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  35.67 
 
 
566 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34 
 
 
534 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  32.17 
 
 
640 aa  274  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.67 
 
 
515 aa  272  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  39.02 
 
 
537 aa  270  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.39 
 
 
528 aa  268  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.74 
 
 
657 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.41 
 
 
681 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.38 
 
 
577 aa  265  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.76 
 
 
577 aa  264  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.54 
 
 
539 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.5 
 
 
585 aa  260  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.18 
 
 
531 aa  259  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.3 
 
 
529 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.45 
 
 
557 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.67 
 
 
524 aa  252  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  36.64 
 
 
563 aa  251  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.91 
 
 
556 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.85 
 
 
589 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.02 
 
 
511 aa  243  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.83 
 
 
584 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4046  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.08 
 
 
559 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  decreased coverage  0.00136288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.3 
 
 
582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.75 
 
 
514 aa  241  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.38 
 
 
517 aa  239  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  35.73 
 
 
558 aa  237  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.73 
 
 
558 aa  237  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.51 
 
 
548 aa  236  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.93 
 
 
583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.36 
 
 
548 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  32.66 
 
 
574 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.56 
 
 
514 aa  231  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.62 
 
 
513 aa  230  9e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  33.92 
 
 
581 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.24 
 
 
598 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.19 
 
 
597 aa  228  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.18 
 
 
513 aa  227  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.26 
 
 
517 aa  227  8e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  33.7 
 
 
581 aa  227  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.91 
 
 
582 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.27 
 
 
512 aa  226  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.7 
 
 
515 aa  225  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  33.48 
 
 
581 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.89 
 
 
510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.37 
 
 
582 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.5 
 
 
572 aa  221  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.28 
 
 
645 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  32.73 
 
 
551 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.4 
 
 
579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.28 
 
 
645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.22 
 
 
599 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.93 
 
 
588 aa  214  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.25 
 
 
601 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.09 
 
 
616 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.56 
 
 
521 aa  211  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.52 
 
 
544 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.56 
 
 
530 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.28 
 
 
634 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.67 
 
 
558 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.02 
 
 
589 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  31.67 
 
 
671 aa  204  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.26 
 
 
552 aa  203  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.75 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  31.13 
 
 
585 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.53 
 
 
1229 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.97 
 
 
597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  31.18 
 
 
1277 aa  198  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.37 
 
 
1212 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.14 
 
 
1211 aa  197  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.46 
 
 
1226 aa  196  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.9 
 
 
587 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.84 
 
 
568 aa  195  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  31.57 
 
 
1218 aa  195  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.87 
 
 
651 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.22 
 
 
568 aa  194  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.82 
 
 
568 aa  194  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2210  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.9 
 
 
586 aa  193  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  30.79 
 
 
600 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.57 
 
 
626 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  31.98 
 
 
611 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.02 
 
 
1210 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.21 
 
 
1213 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.25 
 
 
624 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>