223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9149 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  100 
 
 
566 aa  1164    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.87 
 
 
580 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  39.1 
 
 
578 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.09 
 
 
577 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.17 
 
 
582 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.15 
 
 
519 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.31 
 
 
541 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.26 
 
 
579 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.73 
 
 
582 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.75 
 
 
527 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.61 
 
 
577 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.27 
 
 
575 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  37.87 
 
 
574 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.53 
 
 
528 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.4 
 
 
531 aa  361  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.97 
 
 
515 aa  359  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.04 
 
 
524 aa  359  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.36 
 
 
534 aa  347  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.25 
 
 
529 aa  345  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.52 
 
 
577 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.55 
 
 
556 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.26 
 
 
564 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  39.89 
 
 
537 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.3 
 
 
601 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.69 
 
 
645 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.99 
 
 
597 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.62 
 
 
511 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.3 
 
 
616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.37 
 
 
584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.68 
 
 
589 aa  306  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  32.68 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.48 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.21 
 
 
645 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.98 
 
 
586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.6 
 
 
539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.24 
 
 
562 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.38 
 
 
512 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  34.36 
 
 
563 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.54 
 
 
513 aa  296  6e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  33.81 
 
 
585 aa  296  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.83 
 
 
628 aa  296  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.44 
 
 
657 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.48 
 
 
513 aa  291  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.58 
 
 
510 aa  288  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.56 
 
 
583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.46 
 
 
594 aa  288  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.87 
 
 
514 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.16 
 
 
632 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.81 
 
 
557 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  35.61 
 
 
558 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.61 
 
 
558 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.27 
 
 
514 aa  282  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  35.12 
 
 
565 aa  281  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.37 
 
 
681 aa  279  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.71 
 
 
629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.52 
 
 
671 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.7 
 
 
517 aa  273  7e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.65 
 
 
1258 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.21 
 
 
544 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.91 
 
 
517 aa  271  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.08 
 
 
519 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.07 
 
 
1230 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.21 
 
 
1206 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.01 
 
 
845 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  32.25 
 
 
581 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.12 
 
 
1234 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.08 
 
 
515 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  34.47 
 
 
674 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.08 
 
 
515 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.9 
 
 
1218 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.15 
 
 
1212 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  32.07 
 
 
581 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  32.07 
 
 
581 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.47 
 
 
1206 aa  262  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.4 
 
 
1206 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34 
 
 
629 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.93 
 
 
585 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 
548 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.3 
 
 
561 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.44 
 
 
597 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  33.58 
 
 
1203 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.16 
 
 
1212 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  33.94 
 
 
577 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  33.15 
 
 
548 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  33.58 
 
 
1198 aa  257  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.14 
 
 
564 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.5 
 
 
588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.63 
 
 
660 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.09 
 
 
598 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.53 
 
 
1210 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  32.29 
 
 
551 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.28 
 
 
1220 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.7 
 
 
1242 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  33.71 
 
 
1209 aa  250  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.65 
 
 
1203 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.11 
 
 
561 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  31.74 
 
 
613 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.69 
 
 
558 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.98 
 
 
521 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  31.32 
 
 
647 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>