222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6535 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
582 aa  1181    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.13 
 
 
579 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  52.51 
 
 
574 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.92 
 
 
580 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  39.17 
 
 
566 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.98 
 
 
527 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.86 
 
 
528 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.7 
 
 
541 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.62 
 
 
515 aa  363  6e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.21 
 
 
575 aa  360  5e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.62 
 
 
524 aa  349  8e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.28 
 
 
577 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.2 
 
 
578 aa  347  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.42 
 
 
577 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.43 
 
 
529 aa  340  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.38 
 
 
519 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.15 
 
 
534 aa  332  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.52 
 
 
531 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.12 
 
 
582 aa  323  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  37.9 
 
 
537 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.77 
 
 
539 aa  309  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.26 
 
 
512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.48 
 
 
556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.1 
 
 
577 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.32 
 
 
564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.06 
 
 
1258 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.75 
 
 
511 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.08 
 
 
519 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.94 
 
 
513 aa  299  9e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.21 
 
 
513 aa  297  4e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.9 
 
 
515 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.9 
 
 
515 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.09 
 
 
671 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  32.98 
 
 
613 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.94 
 
 
601 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.65 
 
 
514 aa  292  9e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.37 
 
 
515 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  31.45 
 
 
640 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.5 
 
 
616 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.77 
 
 
1206 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.89 
 
 
1206 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.11 
 
 
1220 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.66 
 
 
517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.54 
 
 
1234 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2245  hydantoinase B/oxoprolinase  34.9 
 
 
518 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.76 
 
 
510 aa  283  6.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.63 
 
 
1242 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.82 
 
 
1210 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  32.42 
 
 
611 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.07 
 
 
1213 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.9 
 
 
1206 aa  279  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.28 
 
 
514 aa  278  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.9 
 
 
1211 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  34.26 
 
 
1209 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  32.97 
 
 
565 aa  278  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.22 
 
 
586 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.5 
 
 
562 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.62 
 
 
597 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.9 
 
 
1212 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  33.76 
 
 
1203 aa  274  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.4 
 
 
1226 aa  274  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.9 
 
 
1229 aa  273  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.64 
 
 
1212 aa  273  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  32.44 
 
 
585 aa  273  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.37 
 
 
1382 aa  273  8.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35 
 
 
544 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  31.64 
 
 
647 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  33.7 
 
 
1271 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05320  5-oxoprolinase, putative  31.98 
 
 
576 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  36.29 
 
 
558 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.4 
 
 
633 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.29 
 
 
558 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  33.33 
 
 
1218 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.21 
 
 
1203 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.51 
 
 
594 aa  270  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  32.78 
 
 
1198 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  32.85 
 
 
563 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.2 
 
 
624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  33.45 
 
 
577 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.15 
 
 
584 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.82 
 
 
517 aa  266  8e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.39 
 
 
1222 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 
1230 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.36 
 
 
670 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.39 
 
 
1218 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.91 
 
 
645 aa  263  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.95 
 
 
1205 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.94 
 
 
589 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.26 
 
 
1293 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1380  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.98 
 
 
1239 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  31.37 
 
 
674 aa  261  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2480  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.98 
 
 
1250 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.020178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3295  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.73 
 
 
1220 aa  260  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  31.48 
 
 
582 aa  259  8e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
1307 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.59 
 
 
1217 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.56 
 
 
645 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.03 
 
 
561 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.28 
 
 
632 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.61 
 
 
597 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>