222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0791 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  56.82 
 
 
671 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
670 aa  1372    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.58 
 
 
652 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  35.41 
 
 
674 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.18 
 
 
660 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  33.96 
 
 
647 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2849  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.5 
 
 
628 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.67 
 
 
582 aa  311  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.88 
 
 
580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.71 
 
 
578 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.65 
 
 
577 aa  293  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.16 
 
 
616 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.48 
 
 
601 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.88 
 
 
582 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
597 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.92 
 
 
577 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.68 
 
 
519 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.91 
 
 
556 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.87 
 
 
527 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.06 
 
 
577 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.85 
 
 
534 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.39 
 
 
562 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.3 
 
 
645 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  32.13 
 
 
585 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.39 
 
 
584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  30.74 
 
 
566 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.58 
 
 
524 aa  243  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.27 
 
 
564 aa  243  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.42 
 
 
585 aa  241  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.8 
 
 
645 aa  241  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.08 
 
 
586 aa  240  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.9 
 
 
579 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.96 
 
 
515 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.23 
 
 
657 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.11 
 
 
628 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.73 
 
 
589 aa  234  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.09 
 
 
583 aa  232  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  30.42 
 
 
563 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.48 
 
 
594 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  29.95 
 
 
611 aa  230  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.21 
 
 
575 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.9 
 
 
598 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  31.08 
 
 
623 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.39 
 
 
528 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  29.2 
 
 
640 aa  220  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.87 
 
 
632 aa  220  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.57 
 
 
531 aa  218  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.55 
 
 
597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  34.14 
 
 
537 aa  218  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.21 
 
 
633 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.86 
 
 
511 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.49 
 
 
613 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  30.61 
 
 
574 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.07 
 
 
629 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.58 
 
 
568 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.86 
 
 
558 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.94 
 
 
513 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.26 
 
 
624 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  32.16 
 
 
565 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.15 
 
 
541 aa  208  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.62 
 
 
514 aa  207  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.11 
 
 
557 aa  207  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.45 
 
 
544 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.51 
 
 
587 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.72 
 
 
519 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.28 
 
 
681 aa  203  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.63 
 
 
561 aa  203  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.94 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.33 
 
 
1213 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.91 
 
 
572 aa  198  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.54 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  30.99 
 
 
558 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.17 
 
 
599 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.99 
 
 
558 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.57 
 
 
510 aa  196  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  28.02 
 
 
647 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.44 
 
 
552 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.58 
 
 
564 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.37 
 
 
513 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.21 
 
 
581 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1497  hydantoinase B/oxoprolinase  28.22 
 
 
659 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00877273  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  29.37 
 
 
1355 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.92 
 
 
514 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.99 
 
 
529 aa  190  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.73 
 
 
845 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.08 
 
 
1220 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.38 
 
 
1212 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.84 
 
 
568 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.7 
 
 
515 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.7 
 
 
515 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  28.98 
 
 
581 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.86 
 
 
1258 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  30.56 
 
 
1209 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  26.91 
 
 
579 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.3 
 
 
629 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.57 
 
 
1206 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.5 
 
 
539 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  28.47 
 
 
581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  29.37 
 
 
581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.88 
 
 
517 aa  181  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>