36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7380 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 130 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  41.98 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  38.93 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  41.41 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  42.86 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  44.64 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  36.15 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  34.56 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  37.04 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  38.69 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  37.82 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  36.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  39.02 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  37.19 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  31.21 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  36.76 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  30.25 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  33.87 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  34.71 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  32.67 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  31.34 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  32.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  46.67 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 130 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  25.4 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>