28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1536 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  51.91 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  60.61 
 
 		 99 aa  126  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  43.44 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  37.04 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  36.23 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  34.33 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  34.53 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  31.58 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  29.93 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  34.04 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  31.18 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  28.45 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  30.43 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  30.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  32.99 
 
 		 137 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  26.88 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>