37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9511 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  62.22 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  54.01 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  54.01 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  41.35 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  41.98 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  36.76 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  37.14 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  38.03 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  36.5 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  37.59 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  35.11 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  36.13 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  29.31 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  35.45 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  27.87 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  56.1 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  31.75 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0687  hypothetical protein  36 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.189758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  27.42 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  47.73 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 143 aa  40  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>