15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1169 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  65.91 
 
 		 132 aa  184  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  46.92 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  48.46 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0090  hypothetical protein  44.58 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  26.61 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  30.08 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  27.82 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  26.76 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  32.76 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  29.32 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>