16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0930 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  65.91 
 
 		 132 aa  184  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  42.31 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0090  hypothetical protein  38.83 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  29.08 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  28.45 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 		 138 aa  43.5  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  26.52 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  32.28 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  26.45 
 
 		 141 aa  40  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>