26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3053 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  40.85 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  36.43 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  39.02 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  31.88 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  35.11 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  30.5 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  32.09 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  31.5 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  36.23 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  27.82 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  21.32 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  28 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  31.01 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  28.67 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>