28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2763 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  279  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  74.1 
 
 		 145 aa  213  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  70.15 
 
 		 144 aa  190  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  37.3 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  31.34 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  34.09 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  30 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  35.82 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  34.51 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  30.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  36.43 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  29.66 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  28.89 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  30.5 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  26.19 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  32.54 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>