36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0241 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  34.92 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  34.56 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  34.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  33.33 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  37.74 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  35.82 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  38.71 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  41.11 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  33.6 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  37.21 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  36.15 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  38.2 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  39.23 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0412  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  35.04 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0900207  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  40.22 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  30.95 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  28.87 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  33.07 
 
 		 144 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  31.79 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 130 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  31.63 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>