12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1017 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  248  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2777  PilT protein domain protein  45.24 
 
 
130 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.293295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2206  PilT protein domain protein  42.86 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  40.4 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  40.82 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  37.23 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  36.67 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  36.26 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  28.32 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  28.87 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  35.56 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>