21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2726 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  100 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  35.88 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  41.94 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  34.19 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  32.79 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  32.5 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  43.59 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  26.05 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  35.48 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  28.32 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  36.36 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  27.82 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  28.45 
 
 		 142 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 137 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2139  hypothetical protein  26.88 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804085  normal  0.443514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  31.53 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  26.79 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>