16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1460 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  203  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  51.96 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  43.59 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  48 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  34.52 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  37.5 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  31.52 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  32.95 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  40.22 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  30.68 
 
 		 143 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  33.64 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  38.57 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>