17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0669 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  51.96 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  35.83 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  37.4 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  31.5 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  34.48 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  34.11 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3424  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  40.8  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  29.03 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  27.21 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>