20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3700 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  100 
 
 		 130 aa  245  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  46.92 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  45.74 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  51.04 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  44.62 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  46.46 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  38.1 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  38.76 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  40.15 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  37.29 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  38.02 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  34.88 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>