15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5200 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  300  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  68.37 
 
 
100 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  44.62 
 
 
130 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  46.92 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  46.09 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  46.79 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  41.53 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  37.98 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  39.53 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  45.86 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  37.31 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  37.9 
 
 
137 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  38.76 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  37.01 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  32.23 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>