16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3163 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  100 
 
 
138 aa  266  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  51.56 
 
 
130 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  43.41 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  48 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  51.14 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  33.9 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  40.16 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  40.15 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  45.86 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  42 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  42.71 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  38.52 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  34.45 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>