13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1951 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  296  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  35.2 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0184  hypothetical protein  29.32 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  37.74 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4165  hypothetical protein  45.24 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00999849  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  26.15 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  36.78 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  34.88 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0412  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  23.78 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0900207  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  38.64 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  30.71 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  37.8 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  29.13 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>