23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2491 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  72.34 
 
 		 143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  41.35 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  32.86 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  29.37 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  27.2 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  27.87 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  31.2 
 
 		 142 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0412  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  23.81 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0900207  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  31.54 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  30.58 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  25.19 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  31.46 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>