22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1214 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  45.16 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  29.77 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3424  PilT protein domain protein  28.06 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  29.01 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  35.4 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  28.45 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  29.51 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2130  PilT domain-containing protein  27.54 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.463542  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>