34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3774 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  62.22 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  56.2 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  56.83 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  39.85 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  43.08 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  35.04 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  37.3 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  40.91 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  37.3 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  31.82 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  37.19 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  35.51 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  28.81 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  39.53 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  32.54 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  31.71 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  25.64 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  32.46 
 
 		 131 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>