18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1760 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  48.46 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  42.31 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  39.84 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0090  hypothetical protein  45.78 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  30.65 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  28.91 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 142 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  29.63 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 139 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>