22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3012 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  84.62 
 
 		 145 aa  229  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  70.15 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  35 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  32.85 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  38.52 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  35 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  35.51 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  36.76 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  26.47 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  31.75 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>