20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1020 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  260  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  34.09 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  33.6 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  37.19 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  26.61 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  28.45 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  31.03 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  31.2 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  32.5 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  25.83 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  30.23 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  30.61 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  30.58 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>