21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1758 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  100 
 
 		 131 aa  260  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  39.37 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  40.16 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  36.15 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  35.24 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  31.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  37.82 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  36.97 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  36.13 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  34.91 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  37.63 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  30.61 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  31.63 
 
 		 142 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  43.18 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  32.28 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>