30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0406 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  32 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  34.81 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  32.86 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  35.66 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  30.22 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  36.29 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  32.33 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  34.55 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  34.91 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  28.83 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  29.9 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  32.82 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  30 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  26.81 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  27.34 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  25.19 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>