17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  42.19 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  31.52 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  29.59 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  29.47 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  24.81 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  25.49 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  26.97 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  26.37 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  28.87 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  19.83 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  30.11 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  25.4 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>