20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1961 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  100 
 
 		 131 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  42.19 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  44.12 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  29.55 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  28.45 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  28.43 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  30.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  31.21 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  34.52 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  26.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  30.83 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  27.82 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>