18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3094 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  61.97 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  37.86 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  42.72 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  29.47 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  37.39 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  33.62 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  33.11 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  31.11 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  31.75 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 143 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  29.03 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  38.71 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  32.54 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>