31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2905 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  266  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  34.81 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  35.19 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  33.88 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  31.2 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  31.54 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  34.45 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  35.4 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  27.87 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  37.39 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  29.86 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  30.51 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  30.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  32.77 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  34.57 
 
 		 105 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  28.8 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  26.87 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  24.24 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  28.46 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  27.01 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>