14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2119 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  61.97 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  44.12 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  30.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  29.21 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  39.23 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  19.83 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  33.64 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>