29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0050 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  45.6 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  41.35 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  35.94 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  25.81 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  38.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0184  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  33.11 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  34.51 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  33.87 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  30.91 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  32.46 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0142  PilT protein domain protein  38.2 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0412  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  28.35 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0900207  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  31.75 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  32.95 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  29.37 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>